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新研究助力微生物組學(xué)的發(fā)展

更新時(shí)間:2020-12-24  |  點(diǎn)擊率:621

所有多細(xì)胞生物體內(nèi)都有大量微生物定居,并且從一開始就伴隨著宿主一起進(jìn)化。天然微生物組,即體內(nèi)和體內(nèi)生存的全部細(xì)菌,病毒和真菌等,對(duì)于宿主至關(guān)重要:例如促進(jìn)營養(yǎng)的吸收以及抵御病原體。

在近一項(xiàng)研究中,來自基爾大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)與來自加州大學(xué)伯克利分校和休斯敦貝勒醫(yī)學(xué)院的專家一起,為微生物組研究開發(fā)了一種新型的改進(jìn)模型系統(tǒng),即所謂的“秀麗隱桿線蟲微生物組”。資源”(CeMbio)。它基于代表線蟲微生物組天然組成的12種細(xì)菌。該模型將支持在各種研究中進(jìn)行更現(xiàn)實(shí)的微生物組研究。由Hinrich Schulenburg教授領(lǐng)導(dǎo)的進(jìn)化生態(tài)學(xué)和遺傳學(xué)小組和Christoph Kaleta教授領(lǐng)導(dǎo)的醫(yī)學(xué)系統(tǒng)生物學(xué)小組的基爾大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)近在科學(xué)雜志《G3: Genes Genomes Genetics》雜志中介紹了CeMbio資源及其主要特征。

基于基爾大學(xué)研究人員的先前工作,即*確定了線蟲秀麗隱桿線蟲的天然細(xì)菌群落,使研究者們能夠研究天然微生物組對(duì)線蟲的生活功能和適應(yīng)性的影響。然后將當(dāng)時(shí)得到完整鑒定的線蟲微生物組的組成范圍縮小到十二種代表性細(xì)菌,之后將它們用于線蟲的定殖實(shí)驗(yàn)。 “我們將這些細(xì)菌分別以純培養(yǎng)物和混合培養(yǎng)物形式轉(zhuǎn)移到無菌蠕蟲中,然后觀察它們的生長”。 “通過這種方式,我們能夠表征單個(gè)細(xì)菌在蠕蟲腸道中定殖的能力以及在自然宿主環(huán)境中不同細(xì)菌之間的相互關(guān)系,” Dirksen繼續(xù)說道。

在工作的第二部分中,科學(xué)家利用了微生物組中存在的所有生物的全基因組序列來重建細(xì)菌的代謝網(wǎng)絡(luò)和代謝能力。因此,使用生物信息學(xué)方法,他們能夠預(yù)測(cè)宿主和微生物組之間可以交換哪些代謝產(chǎn)物。總的來說,他們?yōu)榫€蟲的宿主細(xì)菌相互作用的詳細(xì)研究創(chuàng)造了一個(gè)現(xiàn)實(shí)的微生物組模型的基礎(chǔ)。

借助CeMbio模型,基爾研究人員現(xiàn)在提供的資源可供*線蟲研究界的研究人員公開訪問。除了可以在實(shí)驗(yàn)室條件下輕松培養(yǎng)的細(xì)菌菌株之外,這還包括其*公開的遺傳信息以及代謝網(wǎng)絡(luò)的完整模型。該資源和生成的數(shù)據(jù)庫現(xiàn)在為研究界提供了一個(gè)新穎的工具包,可用于研究線蟲生物學(xué)與自然微生物組相互作用時(shí)從生長到發(fā)育等各個(gè)方面。

此外,基爾研究人員希望該新工具作為微生物組研究的模型系統(tǒng)。總之,CeMbio為*的科學(xué)家提供了一種新穎的資源,可以在自然環(huán)境中研究線蟲模型。因此,這項(xiàng)工作為增進(jìn)對(duì)微生物組影響其宿主生物健康和疾病的機(jī)理的整體理解做出了重要貢獻(xiàn)。

胎牛血清,是由胎牛血漿去除纖維蛋白而形成的一種很復(fù)雜的混合物,含有各種血漿蛋白、多肽、脂肪、碳水化合物、生長因子、激素、無機(jī)物等,其組成成份大部分已知,但還有一部分尚不清楚,這些物質(zhì)對(duì)促進(jìn)細(xì)胞生長或抑制生長活性是達(dá)到生理平衡的。其中不含細(xì)胞、纖維蛋白和凝血因子。

儲(chǔ)存條件

-20°C凍存。

胎牛血清*解凍后,應(yīng)按單次習(xí)慣用量分裝,分裝后的血清仍-20°C凍存。

若置于4°C的血清,應(yīng)在一周內(nèi)用完。

為保證細(xì)胞培養(yǎng)的效果,血清和培養(yǎng)基的配置,應(yīng)遵循“現(xiàn)用現(xiàn)配”原則。配好的培養(yǎng)液,應(yīng)于一周內(nèi)用完。

血清避免反復(fù)凍融,避免在4°C或更高溫度儲(chǔ)存過久,否則會(huì)破壞血清中有效活性成分,影響血清品質(zhì)。

 

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